《微生物与感染》为教育部主管、复旦大学主办的学术类期刊，旨在建立一个学科间交叉﹑基础联系临床和公共卫生预防的平台，以利于传播科研成果，培养学科人才和促进国内外学术交流。本刊内容涉及与人类、动物和植物感染相关的微生物，如病毒、细菌、真菌、立克次体、螺旋体、支原体等的生物学及分子生物学特性，抗感染免疫，实验室诊断技术，临床感染及流行病学与防疫等方面的研究。

《微生物与感染》2011年上海市期刊编校质量检查中获优秀奖。